Abstract:
L'émergence du virus SARS-CoV-2 a conduit à la pandémie de COVID-2 qui s'est propagée dans le monde entier, ce qui a conduit à la déclaration de l'état d'urgence par l'Organisation mondiale de la santé (OMS). À cet égard, la protéase SARS-CoV-2 PLpro, qui possède plusieurs activités enzymatiques essentielles intégrées dans des protéines non structurelles (NSPs), a été mise en évidence. Ce travail vise à étudier et à analyser la structure structurelle de PLpro et à discuter de sa fonction, car il est responsable du clivage des changements d'ubiquitine et d'ISG15 dans la cellule hôte, altérant les réponses immunitaires innées, indiquant que PLpro est une excellente cible médicamenteuse pour la prochaine génération et médicaments antiviraux. Après cela, l'étude des inhibiteurs de PLpro et de son mécanisme de liaison à l'aide d'acides aminés a été discutée, et les propriétés de chaque inhibiteur ont également été discutées
Description:
L’infection par le SARS-CoV-2 est un problème de santé publique mondial. Malgré les mesures prises, l’épidémie semble hors de contrôle et demeure un problème sanitaire et économique. Depuis le début de la pandémie, aucun médicament n’a été confirmé pour le traitement, et il est devenu difficile pour les chercheurs de formuler des traitements efficaces qui nécessitent des dizaines d’années de recherche et coûtent des milliards de dollars. Pour trouver des composés qui peuvent devenir des inhibiteurs prometteurs pour arrêter la propagation du virus, il faut premièrement comprendre le virus SARS-CoV-2 de façon exhaustive. Cela a été fait dans le premier chapitre de notre travail. D’après notre compréhension du SARS-CoV-2, nous avons conclu que le ciblage des principales protéiques comme la protéase papain-like fait l’objet de nombreuses études visant à trouver des composés qui empêchent le virus de se reproduire. Le but de ce travail est de simuler les interactions entre la protéase et leurs natifs inhibiteurs. Pour étudier ces interactions le logiciel PYMOL a été choisi et défini le dans le deuxième chapitre ainsi que le logiciel BioEdit et la banque PDB ces outils ont été utilisés dans le troisième et quatrième chapitre. Dans le troisième chapitre de cette étude, la structure de la protéase papain-like de SARS-CoV-2 a été récupéré, en la téléchargeant à partir de la banque PDB (PDB : 6W9C) et étudié à l’aide du logiciel PYMOL La séquence de protéase papain-like de SARS CoV-2 a été comparées au PLpro du SARS-CoV en utilisant BioEdit. En étudiant la structure de la protéase, il a été découvert qu'elle possède un site actif, la triade catalytique (Cys111 His272 Asp286) qui peut être inhibée pour empêcher le virus de se reproduire. Le quatrième et le dernier chapitre de cette étude, a été consacré aux inhibiteurs de la protéase de papain-like où il existe deux types : les inhibiteurs covalents VIR 250 et VIR 251et les inhibiteurs non covalents : GRL0617, 3K et Epselon…
